そちらで「検索避けにする」にしていれば、おそらくタグにはMATEタグは自動挿入されているので不要だとは思いますが、心配でしたら「自分でHTMLを設置する」を入れてMATEタグを入れてください。
対策済みの場合はこちらの画像で赤色の線で囲んだ部分をタップし、初期の状態では表示するにチェックが入っているので、そちらのチェックを外さないとAliceのトップからも確認できる新着小説や、人気小説のページに反映されて検索避けの意味が無くなるので上手く機能していない場合はこちらの確認もされた方が良いかと思います。
また、どこの検索エンジンで検索したのか知りませんが、METAタグはそもそも強制力はありませんので、うっかり拾ってしまったり無視をしてしまったりする検索ロボットがよくいるので、他の人がピンポイントでURLやサイト名を入れて調べる場合はそちらのサイトを既に知っている方なのであまり心配はないかと思います。(それ以外のワードでヒットするのであれば問題ですが)